Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf85Q96MD7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf85Q96MD7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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C9orf85Q96MD7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C9orf85Q96MD7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C9orf85Q96MD7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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