Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FAM227BQ96M60 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms