Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PRRC1Q96M27 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms