Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX27Q96L92 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms