Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PHACTR3Q96KR7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHACTR3Q96KR7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms