Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJD4Q96KN9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GJD4Q96KN9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJD4Q96KN9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms