Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMX3Q96JJ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMX3Q96JJ7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms