Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC12Q96J65 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ABCC12Q96J65 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms