Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC34Q96HJ3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms