Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMARCD1Q96GM5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms