Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMIM12Q96EX1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SMIM12Q96EX1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms