Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OPTNQ96CV9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OPTNQ96CV9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms