Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HPS3Q969F9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HPS3Q969F9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms