Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CELF1Q92879 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CELF1Q92879 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms