Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC7Q8WUI4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HDAC7Q8WUI4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms