Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
U2AF1L4Q8WU68 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
U2AF1L4Q8WU68 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms