Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CSNK2A3Q8NEV1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms