Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EHBP1Q8NDI1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EHBP1Q8NDI1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms