Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C9orf40Q8IXQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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C9orf40Q8IXQ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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C9orf40Q8IXQ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C9orf40Q8IXQ3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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