Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WDR49Q8IV35 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WDR49Q8IV35 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms