Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB11FIP4Q86YS3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB11FIP4Q86YS3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
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