Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LCA5Q86VQ0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LCA5Q86VQ0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms