Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CTU1Q7Z7A3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTU1Q7Z7A3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms