Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDZD4Q76G19 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDZD4Q76G19 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms