Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SYDE1Q6ZW31 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYDE1Q6ZW31 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms