Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT3

FRMD7, FERM domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD7Q6ZUT3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FRMD7Q6ZUT3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FRMD7Q6ZUT3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms