Protein–RNA interactions for Protein: Q6XD76

ASCL4, Achaete-scute homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL4Q6XD76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ASCL4Q6XD76 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ASCL4Q6XD76 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms