Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4T0

C12orf54, Uncharacterized protein C12orf54, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf54Q6X4T0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C12orf54Q6X4T0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms