Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DUX4L9Q6RFH8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DUX4L9Q6RFH8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms