Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZBED9Q6R2W3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZBED9Q6R2W3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms