Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1Q6PKG0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1Q6PKG0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LARP1Q6PKG0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms