Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC174Q6PII3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC174Q6PII3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms