Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TTC41PQ6P2S7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTC41PQ6P2S7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms