Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GDF6Q6KF10 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms