Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
CARMIL2Q6F5E8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CARMIL2Q6F5E8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CARMIL2Q6F5E8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms