Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ALS2CLQ60I27 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ALS2CLQ60I27 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms