Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNF123Q5XPI4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNF123Q5XPI4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms