Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF18Q5VWM3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRAMEF18Q5VWM3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms