Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C9orf135Q5VTT2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C9orf135Q5VTT2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms