Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HES3Q5TGS1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HES3Q5TGS1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms