Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAPCD1Q5SSQ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms