Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

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Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNT1Q5JUK3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNT1Q5JUK3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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