Protein–RNA interactions for Protein: Q5JT25

RAB41, Ras-related protein Rab-41, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB41Q5JT25 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RAB41Q5JT25 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAB41Q5JT25 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms