Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47AQ5JRC9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47AQ5JRC9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms