Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9S7

DCAF17, DDB1- and CUL4-associated factor 17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF17Q5H9S7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCAF17Q5H9S7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DCAF17Q5H9S7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms