Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC39A12Q504Y0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SLC39A12Q504Y0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms