Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TMEM259Q4ZIN3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms