Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
USP41Q3LFD5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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