Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC96Q2M329 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC96Q2M329 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.6 ms