Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFX7Q2KHR2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFX7Q2KHR2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms